哈佛大学的科学家发明了一种新的基因编辑技术,可以同时引入多达数百万个变异基因,而且不伤害原来的DNA,并大大加快了变异基因的查找过程。
人们常听说的CRISPR编辑技术是利用生物酶切入DNA的特定部位,在DNA自我修复的时候,用一个新的片段替换被切出的部分。可是这种技术难以解决偏靶的问题,一旦出现将造成不可知的后果,另外也难以同时进行大量编辑。
哈佛大学韦斯生物启发工程研究所(Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering)新发明的编辑方法名为反转录子库重组工程(Retron Library Recombineering,简称RLR),在细胞复制的时候,把一个新的DNA片段引入子细胞内,这样在不会伤害原来的DNA的情况下完成了基因编辑。
研究介绍说,反转录子(Retron)同时可以产生多大数百万个基因的变形版,所以可以同时对很多细胞进行实验,创造复杂的变形版基因组合。
不仅如此,新引入的反转录子序列还起到像“条形码”或标签的作用,帮助科学家在大量的变异细胞中追踪到特定的变异,大大缩短了查找的过程。
研究人员用大肠杆菌(E. coli)进行编辑实验,结果显示90%的细菌都结合了编辑后的反转录子序列。以前,为了找到里面出现抗药性变异的基因,研究人员需要逐个测序查找。用了RLR方法后,研究人员通过测序反转录子的“条形码”筛选,直接找到了耐药变异的基因,大幅提升了查找的速度。
研究者之一舒伯特(Max Schubert)说:“在人们发现可以控制细菌的CRISPR行为进行有用的基因编辑之前很长的一段时间里,人们都把CRISPR看作是细菌所做的一种怪异的事情。CRISPR的发明在世界上起到很大影响。反转录子是又一项和细菌相关的革新技术,很有希望会带来重要的发展。”
这份研究5月4日发表于《美国国家科学院院刊》(PNAS)。